Christian JOST

Christian JOST


Maitre de Conférences - Université Toulouse III
05 61 55 64 37

Presentation

Research           Teaching           Publications

For the larger public :

 

Research :

I am interested in the modelling of biological phenomena and in the identification of the mechanisms behind a globally observed pattern. During my PhD the patterns were predator-prey dynamics and I was trying to identify the underlying functional response (predator consumption). Since my arrival at the CRCA (CAB research group) my interests have shifted to the self-oganized phenomena that can be found in social insects. Direct animal observation permits to quantify and model their individual behaviour, which in turn allows to predict (and validate) what should be observed on the collective level. This approach requires to combine tools from statistics and dynamical systems. The current surge in Systems Biology relies exactly on this combination of biological experiment, statistical analysis and dynamic modelling. The self-organized processes in social insects are a compelling biological system where one can control and validate all the steps. See my habilitation thesis for a summary of my activity between 2001 and 2015.

I am particuarly involved in the construction phenomena in social insects such as ants or termites: experimental study, characterisation of the individual behaviours and modelling in order to link to the resulting collective behaviors.

See my google page for more information about reception of my research in the scientific community.

 

Teaching (sorry, only in french):

J’interviens dans les enseignements de Licence, Master 1 et Master 2 dans le contexte de la modélisation en général et du comportement animal en particulier. Ci-dessous une liste des UE dans lesquelles j’interviens principalement.

Heures de présence  : mon bureau se situe dans le Bât 4R3-b3, 3ème étage, porte 301. Envoyez-moi un email si vous avez des questions par rapport à mes cours, on pourra ensuite prendre rendez-vous.

  • L2
    • ’Méthodologie expérimentale en SDV’ (Resp. A. Sévérac-Cauquil)
  • L3
    • 3L5BC7M ’Ethologie’ (Resp G. Isabel)
    • 3L6AB4M ’Ecologie comportementale’ (Resp. C. Jost/R. Bon)
  • M1
    • 3M7BS20M : Cognition Animale
    • 3M7BS15M ’Analyse statistique et modélisation en neurosciences et éthologie’ (Resp. C. Jost)
    • 3M8ELGM ’Comportement : Socialisation et Vie en Société’ (Resp. R. Bon/C. Jost)
  • M2
    • M2R NCC : Neurosciences, Comportement, Cogntion
    • M2I MSE : Modélisation des systèmes écologiques (co-responsable avec Sovan Lek et Emmanuelle Cam)

Des polycopiés d’un intérêt plus large

Les polys ci-dessous sont issus de mon activité d’enseignement et sont peut-être utils pour des enseignants/étudiants en dehors de l’Université Toulouse 3, Paul Sabatier. Merci de me communiquer toute erreur que vous trouvez là-dedans (mailto:christian.jost@univ-tlse3.fr).

  • Modélisation :
    Ce poly donne une introduction à la modélisation illustrée avec des exemples provenant de l’analyse du comportement et de la cognition animale. Il est accompagné d’une série de TP sur ordinateur (avec Netlogo pour les simulations spatiales : http://ccl.northwestern.edu/netlogo/ ; ou avec R pour la modélisation : http://cran.r-project.org/ )
  • Traitement de données en éthologie et cognition :
    Ce poly donne une introduction à l’analyse de données, en particulier dans l’étude du comportement. Les analyses sont fait avec le logiciel R et les données de tous les exemples sont téléchargeables ci-dessous. Le plus efficace et de lire ce poly devant un ordinateur pour faire en même temps les analyses proposées. Attention, ce poly est encore en cours de développement, ne vous étonnez pas si vous découvrez des erreurs. Mais merci de me les communiquer (mailto:christian.jost@univ-tlse3.fr).
  • Les statistiques avec R, Rcmdr et Tableur : une introduction en 4 TP
    Ce poly a été inauguré en 2009 et vise à faire une introduction au traitement statistique sous R sans passer (trop) par la ligne de commande. Il traite les tests sur deux échantillons, l’ANOVA, les chi-2 et, petite excursion dans la ligne de commande et les scripts, le bootstrap pour estimer l’erreur standard.

Remarque : tout le matériel pédagogique sur cette page a été développé dans le cadre de mon travail de Maître de conférences (rémunéré par l’état français), je le mets donc a disposition de toute la communauté francophone sous les conditions de la Licence de la documentation libre de GNU (mais en excluant une utilisation commerciale de ce matériel !).

 

Publications :

See my google page for citation statistics

In Animal behaviour (current research)

 

 

In ecology (PhD and Post-doc)


My academic documents (downloadable)

 

Projets personnels

Jost et al - 2012 - additional material

Fouquet et al 2014 - additional material

Eom et al 2015 - additional material

Université Paul Sabatier
118 Route de Narbonne

31062 TOULOUSE Cedex
France

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