PLATEFORME
Responsable plateforme : Balor Stéphanie
Présentation
La plateforme de Microscopie électronique Intégrative (METi) est une plateforme de microscopie électronique en transmission au sein du Centre de Biologie Intégrative.
Le METi fait partie de la plateforme Genotoul Toulouse Réseau Imagerie (TRI-IBISA) et est certifié norme ISO 9001:2015 – NFX50-900 depuis janvier 2010.
La plateforme est ouverte aux utilisateurs académiques et industriels et offre trois types de services. Nous proposons de la préparation d’échantillon, de la mise à disposition d’équipements et nous pouvons prendre en charge et développer des projets. Notre expertise est centrée sur les sciences du vivant mais nous intervenons dans des projets de nature très diverse (sciences des matériaux, chimie, géologie, …)
Missions principales
– Permettre l’accès aux dernières technologies d’imagerie par Microscopie électronique en Transmission (MET)
– Développer des méthodologies innovantes pour la MET
– Transmettre l’expertise par la formation et l’enseignement
Offres & Expertises
– Imagerie multi-échelles du tissu à la molécule
– Analyse d’images
– Analyse ultrastructurale en 3D in situ et in vitro
Accès
– Prestation de service & gestion de projets
– Accès aux équipements après formation
– Equipes académiques & entreprises privées
Prix/Procédures
– Pour faire une demande de service, ou de devis envoyez un mail à cbi.meti@univ-tlse3.fr
TEM FEG 200 kV équipé d’une caméra à détection directe d’électrons avec un filtre de perte d’énergie post-colonne Gatan K3-BioQuantum et de phase plate
TEM 120 kV équipé d’une caméra CMOS Gatan Rio 9 (9M pixels)
TEM 200 kV équipé d’une caméra US1000 et d’une caméra US4000 avec un filtre de perte d’énergie Gatan GIF Quantum
Automate de congélation ultra-rapide pour congeler des particules mono-disperses (macromolécules, virus, bactéries) dans un fin film de glace vitreuse sur des grilles de microscopie électronique avec une couche de carbone.
Cryofixateur haute pression pour congeler les échantillons dans de la glace vitreuse. Cela permet d’améliorer la qualité morphologique, de permettre de saisir des évènements biologiques de courte durée et d’améliorer la préservation des antigènes qui sont souvent sensibles aux fixateurs chimiques.
Système automatisé de cryo-substitution et d’enrobage dans de la résine à très basse température.
Cryo-utramicrotome pour réaliser des coupes ultrafines à température ambiante mais plus particulièrement dédié aux cryosections pour les techniques Tokuyasu et CEMOVIS
Talos Arctica
TEM FEG 200 kV équipé d’une caméra à détection directe d’électrons avec un filtre de perte d’énergie post-colonne Gatan K3-BioQuantum et de phase plate
Jeol JEM 1400
TEM 120 kV équipé d’une caméra CMOS Gatan Rio 9 (9M pixels)
Jeol JEM 2100
TEM 200 kV équipé d’une caméra US1000 et d’une caméra US4000 avec un filtre de perte d’énergie Gatan GIF Quantum
Leica EMGP
Automate de congélation ultra-rapide pour congeler des particules mono-disperses (macromolécules, virus, bactéries) dans un fin film de glace vitreuse sur des grilles de microscopie électronique avec une couche de carbone.
Leica EM ICE
Cryofixateur haute pression pour congeler les échantillons dans de la glace vitreuse. Cela permet d’améliorer la qualité morphologique, de permettre de saisir des évènements biologiques de courte durée et d’améliorer la préservation des antigènes qui sont souvent sensibles aux fixateurs chimiques.
Leica AFS2/FSP
Système automatisé de cryo-substitution et d’enrobage dans de la résine à très basse température.
Leica UC7/FC7
Cryo-utramicrotome pour réaliser des coupes ultrafines à température ambiante mais plus particulièrement dédié aux cryosections pour les techniques Tokuyasu et CEMOVIS
Projet 1
Le METi est particulièrement investi dans l’implémentation de nouvelles technologies et bénéficie de matériels avancés pour la préparation et l’observation d’échantillons au plus près de leur état natif :
– Cryomicroscopie électronique / Single particle analysis
– Cryométhodes : cryofixation, cryo-substitution et cryosections
– (Cryo) tomographie électronique
Projet 2
Développement de l’imagerie multi-échelle, du tissu à la molécule, pour s’orienter notamment vers des approches de microscopies corrélatives et de biologie structurale in situ pour aller regarder des machines moléculaires dans leur environnement cellulaire ou tissulaire, à une échelle sub-nanométrique. Dans cette optique, les prochains développements du METi sont orientés vers les techniques de volume 3D en microscopie électronique avec les techniques de tomographie Array et cryoFIB-SEM.
Projet 3
Le METi offre des services d’analyse d’images de pointe pour révéler les détails structurels et quantitatifs des échantillons biologiques, à la fois in vitro et in situ. Nous sommes spécialisés dans :
L’analyse de particules individuelles : Alignement et calcul de la moyenne des particules de protéines individuelles pour générer des structures 3D à haute résolution qui révèlent des détails moléculaires complexes.
Subtomogram averaging: Cette technique, actuellement en cours de développement dans notre institut, est idéale pour étudier les grands complexes ou les assemblages flexibles in situ. Elle améliore le signal et la résolution en combinant plusieurs coupes de tomographie.
Segmentation : Identification et isolation des régions d’intérêt dans les volumes tomographiques 3D, permettant une analyse détaillée des composants cellulaires et des complexes moléculaires.
Quantification et analyse des volumes 3D : La mesure de l’abondance, de la distribution et des interactions moléculaires dans différents environnements dans un contexte 3D, fournissent un aperçu complet de la dynamique de l’échantillon.
Nos techniques d’analyse de pointe permettent une caractérisation précise de l’architecture et de la dynamique moléculaires, soutenant ainsi la recherche sur les mécanismes biologiques.
– Integrative in vivo analysis of the ethanolamine utilization bacterial microcompartment in Escherichia coli. Jallet D, Soldan V, Shayan R, Stella A, Ismail N, Zenati R, Cahoreau E, Burlet-Schiltz O, Balor S, Millard P, Heux S.mSystems. 2024 Aug 20;9(8):e0075024. doi: 10.1128/msystems.00750-24. Epub 2024 Jul 18.
– Design, synthesis, and characterization of protein origami based on self-assembly of a brick and staple artificial protein pair. Moreaud L, Viollet S, Urvoas A, Valerio-Lepiniec M, Mesneau A, Li de la Sierra-Gallay I, Miller J, Ouldali M, Marcelot C, Balor S, Soldan V, Meriadec C, Artzner F, Dujardin E, Minard P.Proc Natl Acad Sci U S A. 2023 Mar 14;120(11):e2218428120. doi: 10.1073/pnas.2218428120. Epub 2023 Mar 9.
– Elasticity of podosome actin networks produces nanonewton protrusive forces. Jasnin M, Hervy J, Balor S, Bouissou A, Proag A, Voituriez R, Schneider J, Mangeat T, Maridonneau-Parini I, Baumeister W, Dmitrieff S, Poincloux R.Nat Commun. 2022 Jul 4;13(1):3842. doi: 10.1038/s41467-022-30652-6.
– Good Vibrations: Structural Remodeling of Maturing Yeast Pre-40S Ribosomal Particles Followed by Cryo-Electron Microscopy. Shayan R, Rinaldi D, Larburu N, Plassart L, Balor S, Bouyssié D, Lebaron S, Marcoux J, Gleizes PE, Plisson-Chastang C.Molecules. 2020 Mar 3;25(5):1125. doi: 10.3390/molecules25051125.
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01.
Les plateaux TRI-Genotoul mettent à votre disposition les équipements et expertises nécessaires afin de mener à bien vos projets de R&D
