Mes intérêts se sont progressivement déplacés de l'étude de l'origine et de l'évolution des rétroposons chez les eucaryotes, vers des projets de séquençage systématique avec le développement de nouveaux outils informatiques, et vers la génomique comparative et intégrative. J'ai travaillé sur plusieurs problèmes biologiques en collaboration avec des équipes expérimentales. Mon approche consiste à développer de nouvelles méthodes d'analyse de données en utilisant des logiciels libres, et à aborder les différentes questions d'un point de vue évolutif.