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Lors du séquençage et de l'annotation des génomes, les ORF de moins de 100 codons (small ORF ou smORF) n'ont pas été pris en compte afin d'éviter les fausses annotations de gènes. Cependant, la découverte récente de prétendus ARN non codants (ARNnc) capables de coder des microprotéines de moins de 100 aa à partir de leurs smORF non annotées a mis en lumière une nouvelle population de molécules inconnues. Ces petites protéines traduites à partir des smORF portent différents noms : microprotéines, peptides smORF, micropeptides, SEP ou AltORF. Le développement de techniques à haut débit dédiées à l'identification des smORF potentiellement codant a conduit à l'identification de milliers de smORFdans tous les génomes. Seule une fraction du microprotéome a été explorée, ce qui suggère qu'il constitue un réservoir potentiel de nouveaux régulateurs biologiques. Nous travaillons sur les microprotéines depuis leur émergence, et nous avons déchiffré le mode d’action moléculaire des peptides Pri, pionniers dans le domaine, dans différents tissus à différents stades du développement de la drosophile.
Actuellement, nous identifions de nouvelles microprotéines bioactives qui contrôlent les processus de développement et les fonctions reproductives en utilisant la drosophile comme modèle animal in vivo. En combinant l'imagerie cellulaire, la génétique moléculaire, les approches transcriptomiques et protéomiques, nous visons à déchiffrer la fonction moléculaire des microprotéines in vivo.
When genomes were sequenced and annotated, ORFs of less than 100 codons (small ORF or smORF) were not considered in order to avoid false gene annotations. However, the recent discovery of alleged non-coding RNAs (ncRNAs) capable of coding for microproteins less than 100aa from their unannotated smORFs brought to light a new population of unknown molecules. These small proteins translated from smORFs have different names: microproteins, smORF peptides, micropeptides, SEP or AltORF. The development of high-throughput techniques dedicated to identifying putative encoding smORFs has led to the identification of thousands of smORFs, among millions, in all genomes. Only a fraction of the microproteome has been explored suggesting that it constitutes an overlooked reservoir of biological regulators. We have started to work on the pioneer Pri peptides since the emergence of the microprotein field and deciphered their molecular mode of action in different tissues at different stages of Drosophila development.
At present, we identify novel bioactive microproteins which control developmental processes and reproductive functions using Drosophila as an in vivo animal model. By combining cell imaging, molecular genetics, transcriptomic and proteomic approaches, we aim to decipher the molecular function of microproteins in vivo.