Plateau technique
Présentation
Le plateau technique GENSCAN vise à accompagner les utilisateurs dans la mise en place et l’exécution des différentes méthodes permettant 1-l’analyse du génome, du transcriptome, et de l’épigénome sur des populations cellulaires et 2-d’explorer l’hétérogénéité du transcriptome et de l’épigénome au sein de tissus, d’organes et d’organismes entier par des approches sur cellule unique.
Plus particulièrement, GENSCAN propose :
– La préparation des librairies de RNA-seq, ChIP-seq, ATAC-Seq, DRIP-seq, Hi-C, CUT&RUN, CUT&Tag et leur contrôle qualité avant séquençage.
– La réalisation d’expériences de single-cell RNA-seq, single-cell ATAC-seq, single-cell Multiome (RNA + ATAC sur la même cellule) à l’aide du Chromium Controller (10X Genomics)
– L’accompagnement des utilisateurs dans la conception, la mise en œuvre et l’interprétation des expériences d’analyse génomique sur population et en cellule unique.
– La formation d’utilisateurs experts de certains équipements mutualisés d’analyse en génomique. (Covaris S220, Agilent Bioanalyser 2100, Chromium Controller)
– La mise en œuvre des nouvelles méthodologies en génomique sur population et à l’echelle de la cellule unique.
Équipements
Affiliation
