Plateforme big-A

Marion Aguirrebengoa


IE CNRS
05 61 55 75 65

Membres de l'équipe

  Ingénieur d'études
  • Marion Aguirrebengoa
  Ingénieur de recherches  Chercheur
  • Didier Trouche
  Etudiant en Master
  • Axelle Dubois
  --
  • Philemon Droues

Thèmes de recherche

    Présentation

    Missions de la Plateforme :

    L’utilisation de technologies dites « genome wide » est nécessaire à la poursuite de très nombreux projets. La plateforme locale big-A dédiée à l’analyse de ces données permet à tous d’utiliser ces approches qui sont devenues incontournables dans de nombreux champs d’investigation de l’ensemble des équipes du CBI.

    Les missions de la plateforme sont multiples :

    - Sa première mission est d'accompagner les équipes du CBI dans leurs projets d’analyse de données à grande échelle en fournissant des conseils en amont pour la mise en place du projet et des objectifs puis un accompagnement pour l’analyse des données avec les utilisateurs concernés.

    - Son rôle est aussi de développer des chaînes de traitements sous forme d'interfaces graphiques conviviales, utiles à tous, en fonction des demandes des utilisateurs.

    - Elle est également en charge de la formation des utilisateurs aux outils existants, sous la forme de formation interne CBI (Biostat/R et Bioinfo/Galaxy) et de soutien ponctuel aux utilisateurs. La platefome peut également encadrer des étudiants en master, en stage sur la plateforme ou dans les équipes utilisatrices.

    - Elle participe également au développement d'outils et méthodes pour des projets qui nécessitent une expertise (statistique, mathématique ou bio-informatique) plus avancée (questions complexes, analyses multi-échelles, analyses comparatives et intégrées etc).

    - Enfin elle participe à l’organisation du réseau toulousain bio-informatique en concertation avec les plateformes régionales (plateau bioinformatique I2MC, Genotoul Biostat...), à différents groupes de travail et est chargée de la veille technologique sur les nouvelles techniques et analyses.

    Publications

    Voir toutes les publications

    Financements

         

    Université Paul Sabatier
    118 Route de Narbonne

    31062 TOULOUSE Cedex
    France


    05 61 33 58 00

    Annuaire général