Biologie de l'ARN chez les Archées

Présentation

SYNOPSIS

Béa Clouet-d'Orval, Marie Bouvier & Marta Kwapisz co-supervisent les projets scientifiques de l'équipe.

FOCUS

Le groupe "RNARCHAEA", en étroite collaboration avec des partenaires locaux, nationaux et internationaux, vise à identifier et à caractériser les voies métaboliques de l'ARN qui sont au centre de la régulation transcriptionnelle et post-transcriptionnelle de l'expression des gènes chez les archées. Nous étudions de nouvelles enzymes et machineries qui interviennent dans le contrôle de la qualité de l'ARN, la stabilité de l'ARN et le processing de l'ARN chez les Thermococcales. 

Les archées, qui constituent le troisième domaine de la vie, sont présentes dans tous les écosystèmes et représentent plus de 20 % de la biomasse microbienne dans l'eau des océans et jusqu'à 5 % du sol. Elles ont un métabolisme énergétique varié qui leur confère une importance cruciale dans le cycle bio-géochimique global de la Terre. Les archées sont des importants systèmes modèles pour la compréhension de la vie dans des conditions extrêmes, et ont permis de comprendre l'évolution des processus génétiques moléculaires et des voies centrales de métabolism cellulaire. Nos modèles d'étude, Thermococcus barophilus et Pyrococcus abyssi, sont des archées hyperthermophiles d'eau profonde qui offrent la possibilité unique d'étudier la stabilité de l'ARN, de l'ADN et des protéines à des températures extrêmement élevées (croissance à des températures supérieures à 85°C) et à des pressions élevées, ce qui permet questioner les frontières de la vie.

Projets

Publications

• Hadjeras L, Bouvier M, Canal I, Poljak L, Morin-Ogier Q, Froment C, Burlet-Schlitz O, Hamouche L, Girbal L, Cocaign-Bousquet M, Carpousis AJ..
  Attachment of the RNA degradosome to the bacterial inner cytoplasmic membrane prevents wasteful degradation of rRNA in ribosome assembly intermediates
  PLoS Biology
  2023 Jan
• Gaëlle Hogrel1,a, Sébastien Laurent2,3, Ziad Ibrahim1,b, Jacques Covès1, Eric Girard1, Frank Gabel1, Clarisse Etienne4, Marie-Claire Daugeron5, Béatrice Clouet-d’Orval4, Tamara Basta5, Didier Flament2,3, Bruno Franzetti1,*.
  Characterization of a small tRNA-binding protein that interacts with the archaeal proteasome complex
  Mol Microbiol . 2022 Jul;118(1-2):16-29. doi: 10.1111/mmi.14948. Epub 2022 Jun 15.
  2022 Jul
• Hajj M, Langendijk-Genevaux P, Batista M, Quentin Y, Laurent S, Capeyrou R, Abdel-Razzak Z, Flament D, Chamieh H, Fichant G, Clouet-d'Orval B, Bouvier M..
  Phylogenetic Diversity of Lhr Proteins and Biochemical Activities of the Thermococcales aLhr2 DNA/RNA Helicase
  Biomolecules
  2021 Jun
• D.K. Phung, C. Etienne, M. Batista, P. Langendijk-Genevaux, Y. Moalic, S. Laurent, S. Liuu, V. Morales, M. Jebbar, G. Fichant, M. Bouvier, D. Flament, B. Clouet-d’Orval.
  RNA processing machineries in Archaea: the 5′-3′ exoribonuclease aRNase J of the β-CASP family is engaged specifically with the helicase ASH-Ski2 and the 3′-5′ exoribonucleolytic RNA exosome machinery
  Nucleic Acids Research
  2020 Feb
• Manon Batista1, Petra Langendijk-Genevaux1, Mirna Hajj1,Duy Khanh Phung2, Laura Plassart3, Marie Bouvier1, Gwennaële Fichant1, and Béatrice Clouet-d’Orval1*.
  The Archaeal Specific Helicase of the Ski2-like family, ASH-Ski2, is an authentic RNA helicase
  2019 Dec en préparation

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Financements

Anciens membres

Mirna Hajj- former PhD

Manon Batista- former PhD

Duy Khanh Phung- former PhD

Bashir Saadek- former Post-doc

Laura Plassart- former master student

Dana Rinaldi