Ségrégation active des génomes bactériens : mécanismes et diversité

Présentation

Notre équipe étudie la ségrégation active des chromosomes et des plasmides bactériens. Pour comprendre les mécanismes qui assurent la transmission efficace de ces réplicons aux cellules filles lors de la division cellulaire, nous développons trois axes de recherche principaux : (i) une étude moléculaire de la partition du plasmide F d’Escherichia coli – l’archétype des systèmes de partition -  qui constitue un système modèle simple et autonome : assemblage dynamique du complexe de partition sur le centromère, interactions entre complexes de partition, dynamique du moteur moléculaire médiée par les complexes de partition, déplacements et positionnements de ces différents partenaires au cours du cycle cellulaire, (ii) une étude des systèmes de partition chez la bactérie à génome complexe P. naphtalenivorans, et (iii) la caractérisation de la communication entre les deux processus de transferts verticaux et horizontaux via le système StbAB.

 La reconstitution et la modélisation de toutes les étapes, par des approches combinant la génétique, la biochimie, la microscopie et la modélisation physique sont nécessaires pour comprendre le mécanisme moléculaire de la ségrégation de l’ADN bactérien.

Projets

Publications

• Guilhas, B., Walter, J.-C., Rech, J., David, G. Walliser, N.-O. Palmeri, J., Mathieu-Demazière, C., Parmeggiani, A., Bouet, J.-Y., Le Gall, A. and Nollmann, M.
  ATP-driven separation of liquid phase condensates in bacteria
  Molecular Cell. 79:293-303
  2020 Aug
• Audibert S.*, Tanguy-le-Gac N.*, Rech J., Bouet J.Y., Bystricky K. and Lane D. .
  Role of centromere sites in activation of ParB proteins for partition complex assembly
  PLoS ONE 15(5):e0226472
  2020 May 10.1371/journal.pone.0226472, 2020
• Jean-Yves Bouet and Barbara E. Funnell.
  Plasmid Localization and Partition in Enterobacteriaceae
  EcoSalPlus. 8(2)
  2019 Jun doi:10.1128/ ecosalplus.ESP-0003-2019
• Debaugny, R.E., Sanchez, A., Rech, J., Labourdette, D., Dorignac, J., Geniet, F., Palmeri, J., Parmeggiani, A., Boudscoq, F., Anton Leberre, V., Walter, J.-C. and Bouet, J.-Y.
  A conserved mechanism drives partition complex assembly on bacterial chromosomes and plasmids
  Molecular Systems Biology
  2018 Nov 14: e8516
• Diaz R. E., Sanchez A., Anton Le Berre V. and Bouet J.-Y.
  High Resolution Chromatin Immunoprecipitation: ChIP-sequencing
  Methods in Molecular Biology. In book: The Bacterial Nucleoid, pp.61-73.
  2017 Aug

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