Présentation

Le contrôle fin de la transcription des gènes nécessite une régulation dynamique de la structure de la chromatine, et le rôle précis des marques d'histones dans ce processus est un sujet d'étude intense. En particulier, on sait peu de choses sur le rôle des marques chromatiniennes dans la régulation des éléments transposables (ET). Les ETs sont des composantes majeures des génomes, comprenant environ 20% du génome de la drosophile et jusqu'à 50% chez l'humain. Les ETs sont des éléments génétiques qui menacent la stabilité génomique par leur capacité à se déplacer dans le génome. Une régulation stricte de l'expression des ETs semble essentielle pour le développement normal mais aussi pour la physiologie normale des tissus somatiques adultes puisque leur régulation aberrante est liée à l'infertilité, au cancer et aux maladies neurodégénératives. Comprendre comment les éléments transposables sont régulés au sein du génome est donc une question fondamentale en biologie. Bien que l'on sache que l’hétérochromatine est impliquée dans la répression des ETs, les aspects mécanistiques de cette régulation n'ont pas été établis et une série de questions restent sans réponse. Nous étudions les mécanismes impliqués dans le contrôle de la transcription des gènes et des éléments transposables (ETs) à travers l'étude de la modulation de la chromatine par l'histone déméthylase LSD1, hautement conservée dans l’évolution, et ses cofacteurs. En combinant des approches génomiques et protéomiques avec l'analyse génétique et l'édition du génome dans l'organisme modèle Drosophila melanogaster, nous visons à:

1) Disséquer les mécanismes par lesquels dLsd1 et ses cofacteurs agissent pour réguler transcriptionnellement les ETs.

2) Étudier l'impact de la déplétion de dLSD1 et de ses cofacteurs sur la mobilisation des ETs et la stabilité du génome au cours du développement.

3) Identifier de nouveaux facteurs chromatiniens impliqués dans la répression des ETs. 

Publications

• Julie M.J. Lepesant, Carole Iampietro, Eugenia Galeota, Benoit Auge, Marion Aguirrenbengoa, Clementine Merce, Camille Chaubet, Vincent Rocher, Marc Haenlin, Lucas Waltzer, Mattia Pelizzola and Luisa Di Stefano.
  A dual role of dLsd1 in oogenesis: regulating developmental genes and repressing transposons
  Nucleic Acids Research, 2020 Feb 20;48(3):1206-1224
  2020 Feb
• Altuna M, Urdánoz-Casado A, Sánchez-Ruiz de Gordoa J; Zelaya MV, Labarga A, Lepesant JMJ, Roldán M; Blanco-Luquin I, Perdones A; Larumbe R; Jericó I; Echavarri C; IMéndez-López I; Di Stefano L.; Mendioroz, M..
  DNA methylation signature of human hippocampus in Alzheimer’s disease is linked to neurogenesis.
  Clinical Epigenetics 2019 Jun 19;11(1):91.
  2019 Jun
• Wayne O. Miles, Julie M. J. Lepesant, Jessie Bourdeaux, Manuela Texier, Marc A. Kerenyi, Makoto Nakakido, Ryuji Hamamoto, Stuart H. Orkin, Nicholas J. Dyson, Luisa Di Stefano.
  The LSD1 Family of Histone Demethylases and the Pumilio Posttranscriptional Repressor Function in a Complex Regulatory Feedback Loop
  Molecular and Cellular Biology
  2015 Dec Mol Cell Biol. 2015 Dec;35(24):4199-211. doi: 10.1128/MCB.00755-15.
• 2015 Jan Dietz KN, Di Stefano L, Maher RC, Zhu H, MacDonald ME, Gusella JF and Walker JA. The Drosophila Huntington’s disease gene ortholog dhtt influences chromatin regulation during development. Human Molecular Genetics 2015, Jan 15; 24(2): 330-45
• 2013 Jan Di Stefano L and Dyson N. The emerging roles for histone demethylases in the modulations of signaling pathways. Biomolecular Concepts. 2013; 4(1): 13–27

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Financements

           

Anciens membres

Denis JULLIEN, PhD

Julie LEPESANT, PhD

Carole IAMPIETRO, PhD

Ingrid MONTARRAS

Clémentine MERCE

Camille CHAUBET